元DNA结构改变了DNA纳米技术世界

匿名用户 2020年9月26日 pm7:38 阅读 298

由亚利桑那州立大学和上海交通大学(SJTU)组成的科学家团队,由ASU分子科学学院的Milton Glick教授,ASU生物设计研究所分子设计和仿生中心主任郝浩带领,刚刚宣布创建一种新型的元DNA结构,这将打开光电子学(包括信息存储和加密)以及合成生物学的领域。
这项研究发表在《自然化学》(“元DNA结构”)上,实际上,元DNA自组装概念可能会彻底改变结构DNA纳米技术的微观世界。众所周知,Watson-Crick碱基对的可预测性质和DNA的结构特征已使DNA可用作设计复杂的纳米级结构和设备的通用构件。
“ DNA折纸的发明无疑是DNA技术的一个里程碑,其中长的单链DNA(ssDNA)借助数百条短的DNA短链折叠成指定的形状,” Yan解释说。“然而,组装更大(微米至毫米)大小的DNA结构一直是具有挑战性的,直到最近,这种结构仍限制了DNA折纸的使用。” 新的微米级结构的长度相当于人类头发的宽度,是原始DNA纳米结构的1000倍。

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自2011年以其优雅的DNA折纸纳米结构获得《科学杂志》的封面以来,Yan和合作者一直不懈地努力,利用自然界的灵感,寻求解决复杂的人类问题。
“在当前的研究中,我们开发了一种通用的“元DNA”(M-DNA)策略,该策略允许各种亚微米到微米大小的DNA结构自组装,其方式类似于简单的短DNA链在DNA上自组装的方式。纳米级。”
该小组证明,亚微米级的6螺旋束DNA折纸纳米结构(meta-DNA)可以用作单链DNA(ssDNA)的放大类似物,并且两个包含互补的“ meta-DNA”的meta-DNAs。碱基对”可以形成具有编程的旋律和螺距的双螺旋。
他们使用meta-DNA构件构建了一系列亚微米到微米级的DNAX结构,包括meta-multi-arm结,3D多面体和各种2D / 3D晶格。他们还证明了在meta-DNA上发生的分层链置换反应将DNA的动态特征转移到meta-DNA。
在助理教授Petr Sulc(SMS)的帮助下,他们使用了DNA的粗粒度计算模型来模拟M-DNA的双链结构,并了解所获得的左手和右手结构的不同产量。 。
此外,通过仅改变单个M-DNA的局部柔性及其相互作用,他们就能够构建从一维到3D的一系列亚微米或微米级DNA结构,并具有各种各样的几何形状,包括元-交界处,超双交叉格(M-DX),四面体,八面体,棱柱和六种紧密堆积的晶格。
将来,可以使用M-DNA合理设计更复杂的电路,分子电动机和纳米器件,并将其用于与生物传感和分子计算有关的应用中。这项研究将使创建动态微米级DNA结构(在X后可重新配置)的可行性大大提高。
作者预计,这种M-DNA策略的引入将使DNA纳米技术从纳米转变为微观规模。这将在亚微米和微米规模上创建一系列复杂的静态和动态结构,从而使许多新应用成为可能。
例如,这些结构可以用作用于构图比先前认为的更大和更复杂的复杂功能组件的支架。这一发现还可能导致更复杂,更复杂的行为,这些行为模仿具有不同基于M-DNA的分层链置换反应的组合的细胞或细胞成分。

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