曾有研究证明，给动物高直链淀粉玉米淀粉能通过提高肠道菌群产生氢气，发挥抗氧化并治疗疾病，但是这种来自肠道菌群代谢产生氢气的作用是否足够确定，仍然是值得探讨的问题。最近日本学者通过给产氢能力不同的两种动物进行菌群移植，进一步证明了肠道菌群产氢对预防疾病维持健康的价值。曾有学者发现，不同个体有不同的产氢气能力，不同产氢能力可能是个体健康差异的一个因素。也许为了增加健康，那些身体内细菌产氢气能力差或消耗氢气太强的个体，就需要适当补充氢气，从而提高个体健康水平。

肠道产生氢气的能力巨大，不需要饮用氢水来补充，其实这是非常武断的说法，首先饮用氢水作为一种补充氢气的方法，已经有大量学术研究论文支持。肠道产生氢气的能力虽然不小，但消耗氢气的能力同样非常大，当然肠道菌群产生氢气也一样可以发挥效应，这也是不愿怀疑的。饮用氢水后可以从呼吸气体中测定出氢气迅速增加的证据也说明，来自肠道菌群的氢气数量是远不及饮用氢水后进入血液的数量。最近这个研究证明，肠道菌群产生氢气的能力和抗病能力有密切关系，这也从一个角度说明补充氢气的重要性，因为不是所有人体内的氢气都足够满足需要。又因为氢气的巨大安全性，多多益善，补充氢气就更加符合逻辑。

大约10-100万亿个细菌居住在人类大肠内，这些细菌对人类的健康有非常重要的影响。肠道内大部分细菌对人体是有益的，但有些是有害的。由于大肠是一个缺氧环境，导致氧化还原电势比较低（大肠内是负电位），因此这里更适合厌氧菌生存，厌氧菌不使用氧气作为最终电子接受体或氢受体，厌氧菌内电子接受体和氢受体是一些发酵产物如琥珀酸、乳酸和短链脂肪酸。

氢气是肠道发酵的主要副产品，大部分氢气被其他细菌氧化消耗，其中一些被吸收或随屁排泄。氢气比较稳定，没有电极性，经典学术观点认为对人体没有影响或作用，但最近10年的大量研究提示，氢气具有选择性抗氧化能力，对人体健康可能具有重要作用。