厌氧菌是不需要氧气进行生长的生物。存在于古细菌和真核微生物中。这些是在氧的存在主要是可用氧兼性厌氧菌和通过暴露于氧浓度在大气水平被杀死专性厌氧菌分为。不能使用氧气但不影响大气中生存的生物称为抗氧细菌。

专性厌氧菌进行发酵和厌氧呼吸。兼性厌氧菌在有氧条件下进行有氧呼吸，而在无氧条件下，有的进行发酵而有的则进行无氧呼吸。耐氧细菌严格发酵。

微好氧生物可以进行有氧呼吸，其中一些还可以进行无氧呼吸。

在该化学式中，糖释放出的能量约为每摩尔150 kJ。该能量从每分子葡萄糖的ADP再生2分子ATP。这只是典型的好氧反应从一个糖分子产生的能量的5％。

厌氧菌和古细菌具有几种不同的发酵途径，例如丙酸发酵，丁酸发酵，混合酸发酵，丁二醇发酵，stickland发酵，乙酸生产途径或甲烷生成途径。二手的

一些厌氧细菌产生的毒素对包括人类在内的高级生物极为危险（例如破伤风毒素和肉毒杆菌毒素）。

通过氧的存在形成在细胞杀伤力超氧改变 超氧化物歧化酶和过氧化氢酶由缺乏，专性厌氧菌在氧的存在下死亡。

在净化污水的污水处理设施中，曝气池前可以设置一个厌氧池，以进行反硝化。厌氧罐中使用厌氧微生物。

通过厌氧性生物分解污水和废物中所含的有机物来产生可作为燃料的碳氢化合物气体的尝试正在各个地方得到推广。