肠道菌群，是人体内肠道的微生物，人体的肠道内大约寄生着10万亿个细菌，不同的菌种可以合成不同人体生长发育必须的维生素，还可以和蛋白质残渣合成氨基酸，参与糖类和蛋白质的代谢，同时还能促进矿物元素的吸收。这些营养物质对健康有着重要作用，一旦缺少会引起多种疾病。肠道菌群在肠道中按照一定的比例组合，各菌互相制约，互相依存，形成一种生态平衡，但是当机体的内外环境发生变化，类似长期服用抗生素，敏感肠菌受到抑制，未被抑制的细菌就会乘机繁殖，从而引起菌群失调，正常的生理组合被破坏，而产生的病理性组合、引起临床症状就称为肠道菌群失调症。

肠道菌群失调主要会表现出严重腹泻或慢性腹泻，在使用抗生素治疗过程中，如果突然发生腹泻，或原有腹泻加重，即有可能发生肠道菌群失调。腹泻多为淡黄绿色水样便，有时如蛋花样。真菌感染呈泡沫样稀便，有腥臭味，脓血便。一些旅游者可能会因气候和环境的改变而发生肠道菌群失调，俗称为水土不服。近年来，由于冰箱的普及使用，有的家庭会储存大量的肉食品及疏莱，过久的储存致使食物变质，食用后引起肠道菌群失调，造成呕吐、腹泻，有的出现精神不集中甚至精神恍惚。

白色念珠菌感染一般都由上消化道开始，然后蔓延到小肠甚至肛周，鹅口疮常是白色念珠菌肠炎最早的信号，如小肠黏膜糜烂或者是溃疡会引起多次的无臭黏液脓性粪便，有时呈水泻，并伴有消化不良症状，如果治疗不及时，就会扩散至呼吸道、泌尿道甚至脑组织。白色念珠菌性肠炎是肠道菌群失调最常见的一种。多见于瘦弱的婴儿、消化不良、营养不良、糖尿病、恶性肿瘤、长期使用抗生素或激素的患者。

葡萄球菌感染则会出现排黄绿色稀便，每日3～20余次，伴有腹胀，腹痛一般不著，吐泻严重的人可能会脱水，电解质紊乱、血尿素氮升高、血压下降。这种症状多见于长期使用抗生素（四环素类、氨苄青霉素等）、肾上腺皮质激素和进行肠道手术的老年患者或慢性病患者。

产气荚膜杆菌所产生的β霉素可以引起急性坏死性肿瘤、消耗性疾病、以及使用抗生素、皮质激素等情况下最易发生感染。

绿脓杆菌感染会产生蓝绿色荧光素使粪便带绿色，但并不经常引起腹泻，个别病例粪便中有粉一般，腹痛轻，少数伴有恶心、呕吐、多有水、电解质紊乱，重症可发生休克。绿脓杆菌为条件致病菌，常为继发感染，在婴幼儿、老人、某些恶性肿瘤患者、消耗性疾病患者、以及使用抗生素、皮质激素等情况下最易发生感染。

变形杆菌在一定条件下可为条件致病菌，如普通杆菌、奇异杆菌、摩根氏变形杆菌均会引起食物中毒，无恒变形杆菌会引起婴幼儿夏季腹泻。

当机体的抵抗力降低或其他原因，正常寄生在肠道的肺炎杆菌会引起感染，特别是小儿的严重腹泻。

对于需要施行大手术的患者，手术前注意补充营养，可以肌注丙种球蛋白以提高机体的免疫机能。也可试用注射转移因子，免疫核糖核酸、胸腺素等。

如果是由于巨结肠，胆囊炎所引起的肠球菌过度繁殖、维生素缺乏造成的肠球菌减少或消失、小肠蠕动过快而引起的酵母菌过多等，都必须先除去病因，然后再扶持正常菌群。

若是发酵性腹泻，应该限制碳水化合物，腐败性腹泻就应该限制蛋白质的摄入。增强肠黏膜的局部防御屏障功能，防止细菌易位，应该增加纤维食物。

马上停止原抗生素，应该根据菌群分析以及抗菌药物做敏感试验，选用与机体合适的抗生素以及抑制过度繁殖的细菌，间接扶植肠道繁殖不足的细菌。此外还可以采用广谱抗菌药物将肠道细菌大部分消灭，然后再灌入正常肠道菌群的菌液以使其恢复。

目前常用的益生菌制剂有嗜酸乳杆菌、保加利亚乳杆菌、乳酸乳杆菌、芽胞乳杆菌、双歧杆菌、粪链球菌、大肠杆菌、粪杆菌和枯草杆菌等。还可以用正常人的大便悬液制成复方活菌制剂，用来治疗艰难梭菌所引起的伪膜性肠炎，也能得到较好的效果。

口服益生元制剂，也可以达到扶植正常菌群的目的。如用乳醣扶植肠杆菌，用叶酸扶植肠球菌。应该使用半乳糖甙-果酸，它受细菌分解后形成乳酸或醋酸，使pH值降低，抑制其他细菌，而支持乳杆菌生长。

经动物和人体内试验表明，BIO—4R株具有耐多种抗菌素性，故能阻止其他菌群异常繁殖，克服菌群失调，改善大便性状异常，而且比以往单用抗菌素治疗的疗效更迅捷，并能防止粪链球菌BIO—4R株的耐药因子向大肠杆菌K—12株转移。

中医认为：“泄泻之本，无不由于脾胃”。急性泄泻病多偏实，责在脾胃，慢性泄泻病多为虚，每及脾肾。前者当清热化湿，后者应高补脾肾。